在试管治疗中，胚胎的性别由受精时精子携带的性染色体(X或Y)决定，而囊胚阶段的细胞在显微镜下形态完全相同，无法区分X和Y染色体，所以实验室无法直接通过观察囊胚的形态或外观，以此来判断其性别。同时囊胚也属于早期胚胎，这时男女胚胎在结构上无差异，因此也就不能判断孩子性别。
实验室筛查囊胚性别有什么限制
囊胚就是发育更加成熟的胚胎，它的外形与内部结构要比胚胎更成熟一些，并且内部会产生囊胚液和囊胚腔，移植后的成活率更高。不过在实验室筛查囊胚中，其性别筛查是有限制的，如下所示：
1、技术限制
胚胎师通过显微镜仅能评估囊胚的形态学质量(如细胞数量、分裂均匀度等)，而囊胚评级系统(如Gardner评分)仅反映发育潜能，与性别无关。毕竟囊胚阶段生殖器官尚未形成，外观上无法区分性别，同时常规胚胎培养操作不涉及性别鉴定。
2、法律限制
目前唯一能准确判断囊胚性别的方法是通过胚胎植入前遗传学检测(PGT)，但该技术仅限于医学指征，如避免性连锁遗传病，非医学目的的性别选择在我国是明令禁止的。因此，实验室不会也不允许进行非医学需要的胚胎性别鉴定。
此外，囊胚是发育更成熟的胚胎，通过胚胎是不能分辨胎儿性别的，而有很多人认为胚胎之所以不能分辨性别，主要原因是成熟度不够，所以有人认为比胚胎发育更成熟的囊胚能决定男女是可信的，但经过临床发现，这种推测方法并不可靠。
实验室筛查囊胚性别的条件
实验室筛查囊胚性别的条件如下：
1、医学指征
实验室筛查囊胚性别，必须存在明确的医学需求，如父母携带性染色体遗传病(如杜氏肌营养不良症)、子代有极高概率患严重性别相关疾病等。此类情况下，筛查性别是为了避免遗传病传递，而非单纯选择胎儿性别。
2、技术限制
仅第三代试管婴儿技术(胚胎植入前遗传学检测，PGT)可筛查囊胚性别。该技术需在胚胎培养至囊胚阶段(通常5-6天)，从胚胎外层取3-5个细胞进行染色体分析，从而判断性别。
3、法律与伦理要求
中国及多数国家禁止非医学需要的胎儿性别选择。实验室操作需严格遵守法律法规，仅在符合医学指征且获得伦理委员会批准的情况下，方可进行性别筛查。
需要注意的是，若无医学必要，实验室不会进行性别检测，且私自筛查可能涉及违法。建议将关注点放在胚胎健康和家庭幸福上。
